独中高中系统中，可以分成理科、文商科，有的学校更有商科供学生选择，这在国内外一般高中体系中是特殊的设定，也是独中独特历史与社会背景下所形成的结果，如今更成为国内独中重要的分流体制，也受到不少学生的欢迎，成为独中办学重要的特色。
根据资料显示，独中商科是以技职课程的模式设计，毕竟在上世纪七八十年代中学毕业后能够继续升学的人并不多，大部分毕业生都会直接就业，为了让这些独中毕业生能够有一技之长，日后能够在职场中谋取一官半职，因此透过开办簿记与会计、商业学等科目，让学生在高中时期就获得相关训练，毕业后能够从事商业相关领域的工作。
八十年代末，我国的工业往加工出口的方向发展，成为全球生产链的一环，各种商业活动也受到这个大环境的改变而急速发展，加上国内高等教育的开放，商学院成为文科学生升学的首选，本被设定为技职教育模式的商科开始转型，成为大学商学院人才培育的先行单位，使得商科成为独中重要的办学特色，逐渐走出了一条自己的路线，成为今天独中高中分流重要的一环。
独中商科的发展不仅仅是受到外在环境的影响，从独中内部的角度来看，比起理科教育所需要的实验室设置与实验器材成本成，商科显得更“价廉物美”。从日后就业的角度来看，商科比起文科更具竞争优势，渐渐的形成现今独中系统中高中分流特有的文商与纯商类别。
只是独中商科源自于技职体系，七八十年代在规划设计相关课程时，是针对毕业生能够直接就业的角度为考量，因此主要以实用的技术导向为主，比如实际操作的簿记与会计能力，或是商业学中关于各种商业术语、商业文件类别的掌握都偏向技能应用的能力，目的就是让无法继续升学的独中毕业生能够在职场上谋得好的工作。
然而高等教育普及的今天，中学毕业直接进入职场的情况日益少见，加上这数十年来的资讯改革浪潮下，职场上的文员、书记所从事的簿记与文书处理等工作也早都已经电脑化取代。此外日新月异的资讯工具发展，很多商业活动程序与文件也因为法规与技术的改变而不断更新，董总在推动独中教改的这个时候，也该重新思考商科在基础教育体系中扮演的角色，以及未来是否还能够满足教育发展的需要。
独中是基础教育的一环，董总的教改也以素养教育为目标。从这个角度来看，独中教育应往更重视学生的全面发展，包括学生的批判思考能力、创意思维、问题解决能力以及人文素养的养成，确保毕业生做好准备面对高等教育的升学，甚至是能够拥有在这个多变的社会中适应和自主学习的能力。
而技职教育的出发点所设计的商科课程是为了确保学生毕业后能够迅速投入职场，因此注重实际操作技能和特定职业技能的培养，往往不会强调批判思考与创意思维，这与目前基础教育的发展路线有巨大的落差，因此商科教育的发展与改革成为当务之急，如何让商科能够与基础教育的办学精神契合，让商科教育得以满足独中教育发展的需求，是董总课程相关单位需要思考的问题。
了解全球商业与经济发展
改革意必然需要打破行之有年的惯性，也可能会影响各校的办学安排、师资调配与课程设计，这势必会引起很多方面的压力与反弹，但独中作为基础教育的一环，办学重点应该是培育学生全面发展的角度思考办学方向，可见以技职教育为基础的商科课程改革是刻不容缓事务，尤其是在资讯科技革新速度日新月异的大环境下，如何能够让我们的下一代在全球竞争及人工智能发展的冲击下仍拥有与其竞争的优势是当下各个学科共同的难题，没有任何学科可以回避这个问题。
商科作为今天独中课程重要的一环，如何将批判思考能力、创意思维、问题解决等素养的养成纳入课程中，是一个大挑战，毕竟长久以来董总与各个学校都没有正视相关课程与大环境脱节的问题，比如近年来金融科技（Fintech）的快速发展下，商业领域早已出现了与过去不同的面貌。
加上如今的全球贸易战，如何了解全球商业与经济发展的各种变因，从更宏观与全面的角度分析、思考与批判如今全球化（在地化）的争议，更是今天年轻人必须要有的能力，独中商科教育要持续的发展，就需要思考如何将这些课题与课程结合，才能够确保独中商科教育能够跟上大时代的趋势，学生才不会坠入学著过去的技术与能力，应付未来还未出现的问题与挑战的教育困境，达到学以致用的目标。
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